税務調査に対処するには窓口現金の管理方法や領収書の保存方法、経費概念を理解した準備が必要です。また、税務調査は平日に行われますので診療に支障が出ます。
「医療経営サポート」では税務手続きにつきましては「岡会計事務所」が行います。（岡会計事務所のホームページはこちら。）「岡会計事務所」は税務署に対して申告書の品質保証である「税理士意見書面」を提出しています。
これにより「岡会計事務所」の担当税理士が先生に代わって、税務署に説明を行い、税務調査そのものが省略されることがあります。